olea senegalensis, conocido como lenguado senegalés, es un pez plano de gran importancia comercial en la industria acuícola, caracterizado por su excelente carne, elevado interés por los consumidores y alto precio en el mercado (∼13 €/kg). La producción en Europa se localiza principalmente en España (Andalucía y Galicia), Francia y Portugal, y se espera que alcance las 10.000 toneladas en 2030. En un contexto de calentamiento global, debido al cambio climático, un aspecto de especial relevancia es la resiliencia de las especies frente a estos nuevos retos climáticos, siendo los estadios larvarios donde se activan los principales mecanismos de adaptación. En la industria acuícola, la aclimatación térmica es necesaria para una producción eficiente de las especies.
El objetivo general del proyecto es aumentar el conocimiento de los mecanismos genéticos y epigenéticos de respuesta frente a cambios en la temperatura del agua, en larvas de S. senegalensis, mediante la aplicación de tecnologías ómicas. Para ello, el proyecto se centrará en los elementos transponibles (TEs). Estos elementos son secuencias de DNA que tienen la capacidad de moverse y expandirse por los genomas, llegando a representar casi un 40% del mismo en S. senegalensis. Los TEs son también conocidos por su alta capacidad de remodelación genómica, así como por su activación y movilización frente a estrés ambiental. En el proyecto se realizarán muestreos de larvas pre-metamórficas y post-metamórficas, cultivadas a dos temperaturas (control y tratamiento de +3ºC) y se aplicarán tres técnicas ómicas DNA-seq (genómica), RNA-seq (transcriptómica) y EM-seq (epigenómica/metiloma). Los resultados del proyecto permitirán describir por primera vez la respuesta de S. senegalensis a estrés térmico, mediante el estudio de las secuencias más abundantes y adaptativas del genoma, los TEs, aplicando una aproximación multi-ómica innovadora de última generación.